對立委管碧玲爆料二○○五年有衛福部長邱文達掛名的論文達152篇，疫情往平地移動 柳營現狂犬鼬獾，邱文達昨晚透過幕僚轉述：「絕對沒有這麼多篇！」邱計算後，宏達電下周將推二機一板新產品，確定當年只有31篇他掛名的原著（original paper）論文，國際少年運會 新北2016主辦，其中3篇則是由他擔任第一作者。
對管指稱邱文達有112篇會議報告、4篇案例報告，及4篇「Letter to the editor」，邱表示，學術界一般並未將這些算入學術論文裡；至於管提到他掛名的有32篇原著，但他計算只有31篇，會再確認差了哪1篇。
邱文達透過幕僚指出，二○○五年他擔任萬芳醫院院長、台北醫學大學醫學院和公共衛生研究所教授，算是他學術生涯的顛峰，當時有不少碩博班學生找他當指導教授，因此可能會在學生論文裡掛名。
他從住院醫師迄今學術生涯近40年，估計共發表了400多篇有他掛名的論文。對管碧玲要求行政院長江宜樺徹查，邱文達坦然面對，都有依照學術倫理規範發表論文。，