中職雖設立「仲裁委員會」，
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，但這個組織近乎停擺，
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，最近一次處理相關事務，
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，是4年多前時報鷹隊洋將喬治，
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，提出的侵權申請。
味全龍隊洋將吉彌、時報鷹隊洋將秘雷，
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，曾因不滿提前遭球團解聘，
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，在1993年5月提出仲裁聲請，
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，隔年元月中職召開仲裁委員會，裁定兩隊支付剩餘薪水，順利解決爭議。
1994年俊國熊隊洋將凱文，也因薪資問題提仲裁，但未獲委員會通過；1995年俊國熊隊吳思賢提出仲裁聲請，委員會意見不一，最後統一獅隊出面協調成功。
之後幾年，仲裁委員會僅處理過合約申訴，或球員跳槽那魯灣職棒的爭議，包括俊國熊隊總教練前田益穗、球員張天麟、康明杉、童琮輝等人都曾是主角。
近年僅有喬治在2009年以聯盟、職棒公司使用肖像、涉及侵權為由，向仲裁委員會提出仲裁聲請，但至今沒有進一步的結論。
薪資爭議部分，仲裁委員會從未處理過相關案例，依規定，有意提出仲裁的球員，需以書面向聯盟仲裁委員會提出聲請，受理後才會再進行後續程序。
依據聯盟規章第29章第4條規定，仲裁委員會含主任委員、副主任委員在內，共有5位委員負責處理仲裁申請事宜。，