高鐵資本額一千零五十三億元，
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，累積虧損已達四百七十億元，
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，未來除了須支應營運維修及折舊攤提，
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，還有每年高達兩百卅五億元的折舊攤銷；此外，
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，高鐵公司還須籌五百多億元資金以贖回特別股股本及遲延利息。就算高鐵破產收歸國有，
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，三千多名員工安置、近四千億收買價金，
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，加上高鐵公司可能提出的三千多億補償金，
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，都是政府「難以承受之重」。
在野黨立委不認為高鐵財務嚴峻，
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，但交通部長葉匡時說，
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，明年初高鐵面臨破產危機，就算可「技術性拖延」，像是協調特別股股東要求不提贖回股本訴訟，但也拖不了多久。高鐵局也說，若財務改革過不了，交通部根本沒籌碼與銀行團談判，協商其不提贖回股本訴訟。
高鐵局長胡湘麟說，「時間」是高鐵財務問題最大的壓力，隨時間流逝，財務改革啟動的彈性愈低。他說，高鐵的財務改善方案已在上月底提送立法院院會，希望大選落幕立院開會後排入審查，力拚今年底通過；如今內閣總辭，須待新任交通部長接手，高鐵財改態勢更為膠著。
外界頻喊高鐵破產後收歸國有，但高鐵局官員評估，收歸國有遠比財務改善複雜得多。交通部為了預備強制接管，提「獎勵民間參與交通建設條例部分條文修正草案」，明定ＢＯＴ事業破產後雙方的權利義務，但修正案如今還躺在立院，法源不完備，收歸國有恐有爭議。
交通部官員說，高鐵破產後，收買價金就達三千九百億元，後續若不收歸國營，得以ＯＴ方式招標經營，但能否找到有能力經營的團隊接手，目前還是未知數。
此外，政府還得面臨高鐵三千五百多名員工的安置問題，對政府財務負擔也相當沉重。，