台南市12年國教免試入學辦法有重大改變，
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，南市教育審議委員會已通過，
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，將原訂免試入學學生報名，
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，最多可選填兩校多志願及須列備取名單，
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，改為可填5校多志願並取消備取；原規定若同分由各校自行決定優先比序，
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，也改為統一比序，並取消加權計分。
教育局長鄭邦鎮表示，做此修改是要解除家長的疑慮，並加速分發作業。由於是第一次實施，超額比序等相關規定是否要修正，將視實施後的情形再做討論。
依照台南區高中職免試入學作業要點，第一階段免試入學學生報名，最多可選填兩校多志願，且學校必須列備取名單。另規定學校可以選擇比序項目加權，若分數同分，進行超額比序，但優先比序項目由各校自行訂定，如有的學校規定先比會考分數，再比競賽分數等。
由於其他縣市的高中職免試入學，至少都可選填7個學校，且都不列備取名單。為了避免部分學生沒有依自己可能上的學校做選填，因而導致落榜，並考量列備取名單會增加分發作業的困擾，且加長學生與家長的煎熬時間，南市教育審議委員會前天通過，改為規定可填5校多志願，並取消列備取名單。
另讓學校自訂優先比序，及可選擇部分比序項目做分數加權，也可能使家長及學生霧煞煞，且易造成不公平，審議委員會也決定取消加權，並統一優先比序的比分。
部分審議委員認為，12年國教第一年實施，盡量不要讓入學辦法過於複雜，因此有這些修改。另也有許多老師及家長反映超額比序項目太多，沒有減輕壓力，反而增加壓力，對此，教育局表示等實施後會視實際狀況研究並討論是否修改。，