儘管兩岸兩會協商交流處於停擺狀態，
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，但蔡政府兩岸事務團隊持續進行整隊；據了解，
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，陸委會主委張小月辦公室主任蔡孟君將出任海基會副秘書長，
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，這意味蔡政府打破傳統，
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，海基會將不再有兼職的陸委會官員。在擔任張小月辦公室主任前，
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，蔡孟君是民進黨中國事務部副主任，
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，之前則是在小英基金會擔任幕僚。黨政人士透露，高層認為蔡孟君年輕、有潛力，希望她到兩岸第一線的海基會增加歷練。蔡孟君自去年520以來擔任張小月辦公室主任的背景，高層也認為未來將有助於海陸兩會的溝通聯繫。另有兩岸事務核心人士表示，這項人事安排是有意義的，兩岸未來協商談判隊伍已經開始在整隊了。據悉，蔡孟君的人事案已進入行政程序，預計這個月中下旬上任。蔡到任後，現任陸委會主任秘書、海基會副秘書長兼發言人李麗珍將卸下海基會的職務，專任陸委會主秘。由於海陸兩會歷來都有陸委會副主委或主任秘書，在海基會兼任秘書長或副秘書長的傳統，也象徵「海陸一條鞭」的指揮運作。如今蔡政府打破傳統，未來陸委會官員將退出海基會，對此，黨政高層解釋，張小月與海基會董事長田弘茂合作相當有默契，且陸委會官員平日業務已相當繁重，在兩會溝通順暢的情況下，官員已無必要再「兩邊跑」。立法院5月已初審通過「大陸委員會組織法草案」，將現行的三位政務副主委改制為二政務、一常務。據了解，高層對常務副主委已有屬意的人選，但目前的林正義、張天欽、邱垂正三位副主委勢必將有一人異動。除了蔡孟君之外，台灣高等法院高雄分院法官管安露1日也已轉任海基會副秘書長，加上現任的羅懷家，海基會編制上的三位副秘書長都將到位，加上秘書長柯承亨，都是支領薪水，享有配車及司機的專職待遇。，