海科館試營運期間，帶酒罰5千！男客怒 開槍恐嚇KTV，不少展品都被玩壞，Mr. Onion將於9月進駐新竹大遠百，甚至兒童廳的玩偶還被偷，南韓考慮任命申鉉松為下任央行總裁，得時常「補貨」。但館方人員觀察，自從正式營運後，海科館的展品就沒有再被玩壞，最夯的兒童廳也不再有「玩偶偷竊案」，遊客素質明顯提升。
國立海洋科技博物館上月底正式營運，館方利用休館期間修復被玩壞的展品，不少展品都可以正常使用。如日前被玩壞的強化玻璃偏光鏡，現在能夠正常推動；被拉扯斷掉的感應棒，也恢復正常。
至於場館最夯的兒童廳，則不再有娃娃被偷，之前「落難的媽祖玩偶」，則回到模擬的神龕裡。館方為避免玩偶又被拔走，特別加裝壓克力板。
負責營運的慶陽團隊則在兒童廳請工讀生駐守，遇上周末假日就加派人力，一次就有3名工讀生負責維持廳內秩序。若發現有兒童在館內攀爬，工讀生也會阻止。
海科館研究規畫組長施彤煒說，自從正式營運後，確實沒有展品又被玩壞，推測是收取門票費用後，「價錢自動篩選顧客」。雖然試營運時狀況不佳，但現在觀展遊客品質有明顯提升。
施彤煒表示，海科館在休館期間都會維修損壞展品，但避免展品又被玩壞，未來也會加強志工訓練，若發現遊客的動作、行為可能會無意間毀損展品，會立即勸導。，